我在实验室里的日子

bai

沒有。
想多了解而已

flyingfish

sushi兄。。哇，全部自己写？很厉害。。但很辛苦。

bai兄，有空多分享。。
你的可能最intensive..连软件也较特别。。好像还用parallel computing..
http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_dynamics
刚看了，没有一个软件我听过。。

rocket兄，你还用真多种软件。。
请教你用finite element, finite volume, finite difference method ?
刚看了一些，真是大学问。。

新加坡他们搞grid computing, 网站：
http://www.ngp.org.sg/

high performance computing:
http://www.ihpc.a-star.edu.sg/

期待断兄的故事。。觉得computing performance影响research cycle time..很重
要。。

斷羽鳥

原帖由 flyingfish 于 17-5-2009 10:19 PM 发表
sushi兄。。哇，全部自己写？很厉害。。但很辛苦。

bai兄，有空多分享。。
你的可能最intensive..连软件也较特别。。好像还用parallel computing..
http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_dynamics
刚看了， ...

呼？ 没什么好讲啊 。。。
有些research是不需要很大computing resources，有些却要。就酱而已 。。。马来西亚这里，还没有真正一项research需要用到酱level的computing power。

TonyDaisie

请问数学外行的我要学matlab或sas之类的software有可能自己来吗？？
或者需要有programming的底？
minitab, spss 跟 matlab 的分别在那里？？
请指教。。。

lamcouz

原帖由 bai 于 17-5-2009 01:13 PM 发表
請問有人在做和molecular dynamics 有關的咚咚嗎？

你是指生物结构学吗，小弟有少许经验

sunyat99

用Schrödinger's Equation 来计算 finite potential well 就是PDE...这个都是给HBT device modeling...如何记算potential barrier in P-N junction... 就是在solve PDE...

斷羽鳥

原帖由 TonyDaisie 于 18-5-2009 01:26 AM 发表
请问数学外行的我要学matlab或sas之类的software有可能自己来吗？？
或者需要有programming的底？
minitab, spss 跟 matlab 的分别在那里？？
请指教。。。

没有什么是不可能的 。。。
sas，minitab， SPSS都是特定给statistical analysis的。sas, minitab, 用起来会比较圆滑，因为user interactivity比较多。SPSS就比较少interactivity，但比较多功能。 这3种我都没深入用过。 MATLAB就是general purpose的programming environment，不一定是statistical的咚咚。能够编写你自己需要的program。

斷羽鳥

原帖由 sunyat99 于 18-5-2009 08:24 AM 发表
用Schrödinger's Equation 来计算 finite potential well 就是PDE...这个都是给HBT device modeling...如何记算potential barrier in P-N junction... 就是在solve PDE...

你对solving PDE在行吗？

sushi-x

原帖由 flyingfish 于 18-5-2009 12:19 AM 发表
sushi兄。。哇，全部自己写？很厉害。。但很辛苦。

bai兄，有空多分享。。
你的可能最intensive..连软件也较特别。。好像还用parallel computing..
http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_dynamics
刚看了， ...

其实说到efficiency，自己写c++不如matlab，这是自己的经验，不过如果像我以前fyp的supervisor那么吊，也没办法了。。。

原帖由 TonyDaisie 于 18-5-2009 03:26 AM 发表
请问数学外行的我要学matlab或sas之类的software有可能自己来吗？？
或者需要有programming的底？
minitab, spss 跟 matlab 的分别在那里？？
请指教。。。

没用过spss
不过minitab和matlab的分别是一个是GUI(pre program),一个是command interface
分别是一个flexible另一个不。
没programming底的用GUI就很简单，不过想要flexibility 的还是matlab之类的programming application

flyingfish

谢谢sunyat兄。。
另一个numerical analysis大领域是optimization..(也许断兄是作这个)，
所以想问问是否大家是作PDE。。

你作simulation用什么软件？

知道我们EE也有一大堆PDE，只是没想到有这么多没听过的algorithm, method..
乘机请教。。
(之前有个EE同学作simulation PhD，作到没日没夜，睡觉，走路都在想simulation...)

发现很多PDE algorithm, method..：
http://www.researchandmarkets.co ... amp;t=t&cat_id=

http://www.researchandmarkets.co ... amp;t=t&cat_id=

wikipedia那里还这样写：
The three most widely used numerical methods to solve PDEs are the  (FEM),
(FVM) and  (FDM). The FEM has a prominent position among these methods
and especially its exceptionally efficient higher-order version . Other
versions of FEM include the generalized finite element method (GFEM),  (XFEM),  (SFEM), ,  (DGFEM), etc.

flyingfish

Tony兄。。
很多statistical package:
http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_statistical_packages

用过JMP(也是SAS Institute的)；Minitab(短时间用过)。。
作equipment qualification, process qualification，常要看它们matched否。。

觉得在statistics,主要不是programming,而是运用然后interprete..

flyingfish

lamcouz兄。。欢迎分享。
请教你是哪一个领域的专家？
生物结构学英文叫什么？

sunyat99

我并不是这方面的专家。。不过有用过matlab来solve triangle potential well...就只是assignment拿来玩玩。。我是搞电路设计。。只要大概明白model如何得来就行了。。

斷羽鳥

原帖由 sunyat99 于 18-5-2009 11:00 AM 发表
我并不是这方面的专家。。不过有用过matlab来solve triangle potential well...就只是assignment拿来玩玩。。我是搞电路设计。。只要大概明白model如何得来就行了。。

原来 。。。我也是只是比较了解FDM罢了。其他的不太了解。我现在比较有兴趣的是把模式拆了再从组，然后看看我有兴趣的那个部分的细节。我的field可以把很多不同的模式耦合在一起，然后让它们相互作用。

rocketeer

对对。。。 FDM, FVM 和 FEM 是最常用的

FDM 是最古老的方法，用 Taylor expansion 的原理，但要用在复杂的形状就很难了。。。好处是简单

FVM 把 model 切成 small volumes。。。好处是 integral formula 可以 directly discretized。在 fluid dynamics 里很常用，因为 fluid dynamics 里的 equaitons 很多是 in integral form。 FLUENT 是用 FVM 的。

FEM 呢就把 model  切成 elements，可以使 triangles, hexagonal 等等形状, 在 structural analysis 很常用，PATRAN/NASTRAN 是用 FEM 的。

我懂得大概就是这样。。。FDM, FVM 和 FEM 只是 discretize mathematical model 罢了，还要 apply numerical scheme，numerical scheme 还要注意 consistency, convergence 和 stability。 这些我只是知道并没有深入研究。。。

flyingfish

哇，那你3种方法都用过了。。

你的研究是否fluid dynamics, structural analysis分开作。。？
fluid dynamics好了，又作structural analysis。。以此类推。。来explore design
space..

看到断兄的“把很多不同的模式耦合在一起，然后让它们相互作用”。。
这很厉害，也许可以fluid dynamics, structural analysis同时作(？)，会不会快
很多。。？但要interoperability.. 。。断兄的“把模式拆了再重组”也许用得着。

哇。。太谢谢你们了。。学到很多。。

斷羽鳥

原帖由 flyingfish 于 18-5-2009 02:51 PM 发表
哇，那你3种方法都用过了。。

你的研究是否fluid dynamics, structural analysis分开作。。？
fluid dynamics好了，又作structural analysis。。以此类推。。来explore design
space..

看到断兄的“把很多不 ...

耦合的概念不是酱的。
自然界中，有很多过程，是相互作用的。但是这些过程很多时候都是分开来模。耦合就是把这些模拟两样／多样不同过程的各种模式结合。让它们互动。酱做，可以更好的模拟这些过程，但是trade off你的computing resources和模拟的时间。

rocketeer

三种是有用过，但是都不够深入，只懂皮毛罢了。。。

fluid-structure interaction 是更大的学问。。。

flyingfish

断兄，谢谢。。又有新东西学了。
耦合：这个英文叫什么？是不是coupling?
能不能举个例？

晨天

原帖由 斷羽鳥 于 17-5-2009 03:46 PM 发表

大马HPC是一个很大的玩笑 。。。。

鸟哥。。 表卖关子。。。
讲下 HPC。。。 毕竟小弟也是有overlap 这行的。。

小弟很想听大家的意见